盡管目前科學家們對人體感染新冠病毒過程中,抗體與刺突糖蛋白的結合機制已經有所了解,但對其結構很大程度上只能依據靜態圖像來觀測。
(資料圖)
近日,來自伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校的一組研究人員則創建了動態的刺突糖蛋白原子模型,并進行多次模擬,希望借此能在原子層面上觀測人類抗體與新冠病毒所產生的的刺突蛋白結合的過程,從而尋找新的治療方法,更精確地篩選藥物。
刺突糖蛋白即是新冠病毒表面的凸起物(類似于一個個小皇冠)它能與人體細胞表面的受體結合,從而感染人類。
研究人員發現,這種蛋白質有幾個“鉸鏈”或活動部件,這使得蛋白質的頭部能夠在從病毒伸出的觸手上旋轉。為了便于在病毒中活動,刺突蛋白折疊并“包裝”自己。最常見的“包裝”之一是糖基化,指在特定點添加稱為聚糖的糖。
此外,研究人員還注意到,刺突蛋白的運動范圍在不斷增加,使其更能夠彎曲并與細胞表面受體相互作用。聚糖本身也與細胞膜相互作用,使刺突蛋白沿著細胞膜移動并搜索受體。
研究人員表示,他們的發現強調了不僅要了解基因突變的重要性,還要了解糖基化等修飾,以及這些修飾如何提高了感染病毒的可能性和免疫避免的重要性。他們還期待其他研究人員使用他們的模型開發新的診斷方法、疫苗和抗病毒藥物。
“希望在未來,對刺突蛋白的這種新認識將有助于治療工作。我想我們可以用某種能與刺突蛋白體內鉸鏈狀物質結合的化合物來減緩其移動速度,因此可以在原則上降低病毒的效力,”Tajkhorshid教授說。
該論文名為“Posttranslational modifications optimize the ability of SARS-CoV-2 spike for effective interaction with host cell receptors”,目前已經發表在《美國國家科學院院刊》上
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論文原文:
https://www.pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.2119761119
標簽: 原子模型